Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms