Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNTFRP26992 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms