Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB9P17482 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms