Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCL3L1P16619 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms