Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPA1P15085 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPA1P15085 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPA1P15085 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPA1P15085 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPA1P15085 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPA1P15085 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPA1P15085 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms