Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ETFAP13804 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ETFAP13804 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ETFAP13804 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ETFAP13804 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFAP13804 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFAP13804 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFAP13804 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFAP13804 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFAP13804 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ETFAP13804 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms