Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOP1P11387 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOP1P11387 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOP1P11387 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP1P11387 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP1P11387 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOP1P11387 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOP1P11387 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOP1P11387 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOP1P11387 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms