Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HKR1P10072 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HKR1P10072 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms