Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
VSIG8P0DPA2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VSIG8P0DPA2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms