Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CGB3P0DN86 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms