Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13A1P00488 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13A1P00488 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13A1P00488 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13A1P00488 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms