Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD4O95243 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD4O95243 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD4O95243 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD4O95243 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MBD4O95243 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MBD4O95243 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms