Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMUO75648 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMUO75648 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMUO75648 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRMUO75648 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRMUO75648 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRMUO75648 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRMUO75648 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms