Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATP6AP1-204ENST00000439372 604 ntTSL 424.89■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIAA0319L-215ENST00000478463 1489 ntTSL 224.85■■□□□ 1.573e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.573e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PDXK-214ENST00000476084 602 ntTSL 324.83■■□□□ 1.562e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC6A9-211ENST00000533007 508 ntTSL 424.77■■□□□ 1.563e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LUC7L-219ENST00000494545 725 ntTSL 524.74■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENGASE-204ENST00000578419 1381 ntTSL 224.73■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENTPD5-203ENST00000554664 1119 ntTSL 324.7■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRAPPC4-208ENST00000527680 569 ntTSL 224.69■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AP4M1-214ENST00000478501 892 ntTSL 524.69■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXO15-211ENST00000583443 1816 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRAPPC4-210ENST00000531290 1135 ntTSL 224.55■■□□□ 1.523e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PTGES2-207ENST00000483625 898 ntTSL 524.45■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NR1D2-205ENST00000492552 1981 ntTSL 224.44■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 E2F4-210ENST00000568485 707 ntTSL 224.4■■□□□ 1.53e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGBL5-208ENST00000477136 2165 ntTSL 224.35■■□□□ 1.492e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MDK-207ENST00000441869 540 ntTSL 324.31■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEX10-207ENST00000514502 548 ntTSL 424.29■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.483e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SHMT1-210ENST00000583780 332 ntTSL 1 (best)24.15■■□□□ 1.462e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SP2-206ENST00000642065 265 nt24.13■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SETD1A-202ENST00000452917 315 ntTSL 224.13■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.453e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGBL5-206ENST00000451003 581 ntTSL 324.1■■□□□ 1.452e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEX10-206ENST00000510434 907 ntTSL 324.08■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC069368.1-201ENST00000502574 1178 ntTSL 224.07■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.442e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GPAT4-206ENST00000520258 870 ntTSL 224.04■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BTBD3-207ENST00000449299 849 ntTSL 224■■□□□ 1.433e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TRMT44-206ENST00000528167 775 ntTSL 523.99■■□□□ 1.432e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.433e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR1D-210ENST00000627604 565 ntTSL 423.98■■□□□ 1.432e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPP38-202ENST00000378201 833 ntTSL 523.98■■□□□ 1.433e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF664-210ENST00000541448 567 ntTSL 323.92■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SP2-204ENST00000637314 531 ntTSL 223.89■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGPAT2-203ENST00000470861 720 ntTSL 223.88■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PCSK7-203ENST00000525027 1312 ntTSL 423.84■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MAPKAP1-213ENST00000444226 701 ntTSL 323.84■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP250-212ENST00000476146 550 ntTSL 423.74■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BTBD3-208ENST00000450368 485 ntTSL 223.73■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.392e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC6A9-210ENST00000528803 524 ntTSL 423.67■■□□□ 1.383e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.375e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LYRM9-207ENST00000582343 2824 nt23.54■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 STX8-204ENST00000573016 494 ntTSL 523.43■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RTN4R-205ENST00000469601 672 ntTSL 323.34■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PDE1B-209ENST00000611899 628 ntTSL 423.31■■□□□ 1.323e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 IGSF8-203ENST00000448417 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.27■■□□□ 1.323e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 XXYLT1-210ENST00000491138 738 ntTSL 323.23■■□□□ 1.315e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEX10-208ENST00000515760 603 ntTSL 423.18■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EML2-223ENST00000590575 543 ntTSL 323.18■■□□□ 1.32e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM223-203ENST00000527073 563 ntTSL 223.17■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CBARP-205ENST00000591127 933 ntTSL 523.16■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MORN1-201ENST00000378525 1648 ntTSL 223.13■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 223.1■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPP38-206ENST00000451677 323 ntTSL 323.09■■□□□ 1.293e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTF3C5-209ENST00000485692 827 ntTSL 223.08■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NUMB-219ENST00000555987 557 ntTSL 423.03■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CREBL2-202ENST00000540224 667 ntTSL 522.87■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 REC8-207ENST00000560501 653 ntTSL 422.83■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SELENOS-205ENST00000528346 655 ntTSL 322.83■■□□□ 1.253e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM234-211ENST00000491434 1538 ntTSL 1 (best)22.81■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GPD1L-203ENST00000428684 822 ntTSL 522.72■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCNDBP1-208ENST00000566515 1634 ntTSL 522.69■■□□□ 1.222e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LMF1-204ENST00000562226 1088 ntTSL 222.67■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 137.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 953.6 ms