Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPFIA4O75335 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms