Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYTH3O43739 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms