Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRC1O43663 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRC1O43663 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRC1O43663 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRC1O43663 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRC1O43663 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRC1O43663 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms