Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR46O15213 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR46O15213 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR46O15213 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR46O15213 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR46O15213 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR46O15213 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR46O15213 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR46O15213 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR46O15213 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR46O15213 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR46O15213 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR46O15213 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms