Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AGRNO00468 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AGRNO00468 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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