Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E9PMD0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E9PMD0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E9PMD0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E9PMD0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PMD0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PMD0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms