Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVV-1B6SEH8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms