Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALM3A6NDB9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms