Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms