Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms