Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CCDC85BQ15834 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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CCDC85BQ15834 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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CCDC85BQ15834 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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