Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SLIT2-203ENST00000503837 4752 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 EFR3B-204ENST00000403714 7434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PLEKHA6-201ENST00000272203 7401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZBTB43-201ENST00000373457 5695 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NWD1-201ENST00000379808 7254 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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