Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CCDC142Q17RM4 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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