Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RBM46-202ENST00000510397 3626 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR9M1P-202ENST00000641564 3163 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FTH1P3-201ENST00000394290 584 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GLRX3P2-201ENST00000405027 1038 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL358779.1-201ENST00000415465 400 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC068481.1-201ENST00000415520 530 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 OR9A3P-202ENST00000485185 878 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP003119.1-201ENST00000533437 538 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC009121.2-201ENST00000572913 714 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC00710-219ENST00000635054 938 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 HEPACAM2-202ENST00000394468 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ERCC6-208ENST00000515869 3439 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CLN3Q13286 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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