Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FBXL2-222ENST00000538892 2793 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 GINS3-201ENST00000318129 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PSMD4-202ENST00000368884 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PWP1-201ENST00000412830 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 RPL10-204ENST00000424325 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBTB37-204ENST00000427304 2300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 BRINP2-201ENST00000361539 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 RPS6KA5-202ENST00000536315 2993 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 HPD-201ENST00000289004 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC073539.1-201ENST00000599810 2094 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF17-201ENST00000307658 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 AP005060.1-201ENST00000623868 3174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP4-2Q9BYR5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms