Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms