Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC8□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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