Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4BQ13620 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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