Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
GP1BBP13224 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GP1BBP13224 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms