Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RRP12-202ENST00000370992 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CYP39A1-201ENST00000275016 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TNS1-209ENST00000446688 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 GPN1-210ENST00000515877 1646 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC024896.1-201ENST00000500632 2549 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 M1AP-209ENST00000536235 2531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PFKM-225ENST00000551804 2797 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LINC02338-201ENST00000615202 2753 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MAT2B-202ENST00000321757 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LINC01266-201ENST00000420823 3948 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TMTC4-202ENST00000342624 3602 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL359682.1-201ENST00000555328 2490 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ABCB1-201ENST00000265724 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 FAM71C-201ENST00000324341 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SIX1-201ENST00000247182 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PNLIPRP1-214ENST00000528052 1533 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNU1-34P-201ENST00000364421 157 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNA5SP377-201ENST00000390852 112 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNA5SP376-201ENST00000390949 112 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 NIP7P3-201ENST00000404319 515 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RPL7L1P12-201ENST00000417594 729 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 Z83839.1-201ENST00000423412 630 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC245036.2-201ENST00000433549 287 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SNX25P1-201ENST00000441817 834 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RN7SL167P-201ENST00000498381 302 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNA5SP409-201ENST00000516815 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 FLVCR2-213ENST00000556856 1020 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC005670.1-201ENST00000572349 395 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC003965.1-201ENST00000575693 667 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC010615.4-201ENST00000600810 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC116348.4-201ENST00000624127 348 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RHOXF1P3-201ENST00000635058 502 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 COL17A1-203ENST00000393211 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 LEP-201ENST00000308868 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 UGT1A1-202ENST00000360418 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SLF2-201ENST00000238961 7288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SGK1-203ENST00000367857 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ITGB6-211ENST00000620391 4401 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 OR1S1-202ENST00000641544 1474 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MX1-203ENST00000398600 3470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 EIF2A-203ENST00000460851 2198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 ITGB6-203ENST00000409872 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNF38-206ENST00000377885 4985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PPP2R5D-203ENST00000461010 1558 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PTGS1-205ENST00000540753 5375 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TMEM255A-201ENST00000309720 3394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CRX-201ENST00000221996 4470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 NCEH1-205ENST00000538775 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PART1-202ENST00000506884 2068 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CDH18-202ENST00000382275 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 CCDC190-203ENST00000367912 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MYH13-202ENST00000418404 6067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SNORA71E-201ENST00000365032 132 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 C5orf56-202ENST00000378947 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 MAGEC3-202ENST00000409007 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
CACNB1Q02641 AC008074.1-201ENST00000441630 723 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms