Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CEP41-217ENST00000541543 6222 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LRRC7-201ENST00000035383 5000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CACNA1E-201ENST00000357570 7064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SV2C-202ENST00000502798 11035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PPIP5K1-202ENST00000348806 5433 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC110048.2-201ENST00000617013 6721 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MAST4-201ENST00000261569 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NWD1-201ENST00000379808 7254 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC00654-201ENST00000379053 6113 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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