Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAI2-205ENST00000579490 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OSBPL3-203ENST00000396431 2969 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1A-202ENST00000325658 4125 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTG2-202ENST00000409624 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC019322.4-201ENST00000623470 3930 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TPM1-233ENST00000610733 3957 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LST1-203ENST00000339530 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC5-202ENST00000375954 2986 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC074351.1-201ENST00000439413 481 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms