Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 BTN3A3-201ENST00000244519 3002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LYRM1-204ENST00000439021 1558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PTPN13Q12923 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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