Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NAIP-201ENST00000194097 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 WDR44-201ENST00000254029 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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