RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.9□□□□□ -0.02
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.57□□□□□ -0.4
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MSH5O43196 834 aa11□□□□□ -0.65
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.73□□□□□ -0.69
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NACADO15069 1562 aa10.58□□□□□ -0.72
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KCNA4P22459 653 aa10.57□□□□□ -0.72
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.51□□□□□ -0.73
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa10.43□□□□□ -0.74
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.4□□□□□ -0.74
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.29□□□□□ -0.76
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.28□□□□□ -0.76
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BICRAQ9NZM4 1560 aa10.24□□□□□ -0.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.23□□□□□ -0.77
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCRIBQ14160 1630 aa10.21□□□□□ -0.78
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.12□□□□□ -0.79
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.96□□□□□ -0.81
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.93□□□□□ -0.82
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMARCA4P51532 1647 aa9.76□□□□□ -0.85
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMARCA2P51531 1590 aa9.75□□□□□ -0.85
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.73□□□□□ -0.85
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 WIZO95785 1651 aa9.54□□□□□ -0.88
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NESP48681 1621 aa9.49□□□□□ -0.89
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNF39Q9H2S5 420 aa9.43□□□□□ -0.9
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IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.36□□□□□ -0.91
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.35□□□□□ -0.91
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.34□□□□□ -0.91
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 WDR62O43379 1518 aa9.33□□□□□ -0.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 APLP2Q06481 763 aa9.3□□□□□ -0.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRDM2Q13029 1718 aa9.29□□□□□ -0.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CAPN15O75808 1086 aa9.25□□□□□ -0.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.24□□□□□ -0.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ABCC8Q09428 1581 aa9.23□□□□□ -0.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TOPBP1Q92547 1522 aa9.19□□□□□ -0.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.19□□□□□ -0.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IFT140Q96RY7 1462 aa9.18□□□□□ -0.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ABCB7O75027 752 aa9.09□□□□□ -0.95
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
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