Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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