Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
V9GYQ6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
V9GYQ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
V9GYQ6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
V9GYQ6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms