Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GY48 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GY48 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GY48 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
V9GY48 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GY48 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GY48 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GY48 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GY48 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GY48 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GY48 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GY48 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GY48 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GY48 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GY48 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GY48 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
V9GY48 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
V9GY48 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
V9GY48 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
V9GY48 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GY48 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms