Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC61Q9Y6R9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC61Q9Y6R9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms