Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WASHC2CQ9Y4E1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WASHC2CQ9Y4E1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms