Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RAD54L2Q9Y4B4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RAD54L2Q9Y4B4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAD54L2Q9Y4B4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms