Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HDGFL3Q9Y3E1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms