Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GIT1Q9Y2X7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GIT1Q9Y2X7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms