Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM35Q9UPQ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms