Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA4Q9UN74 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA4Q9UN74 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms