Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRQQ9UMZ3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRQQ9UMZ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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